Activité de recherche

Le Centre Biologie Alpine de Piora (CBA) a pour but de promouvoir l'enseignement universitaire, la recherche scientifique et la diffusion des résultats des recherches effectuées dans la région du Val Piora. L'Institut de Microbiologie de la SUPSI (IM-SUPSI) fournit un soutien scientifique à le CBA pour des activités principalement liées à la microbiologie environnementale.

Des recherches scientifiques menées à Piora, coordonnées par l'IM-SUPSI en collaboration notamment avec les universités de Genève et de Zurich, sont financées par le Fonds national suisse de la recherche scientifique (FNS) pour la recherche.

Le FNS finance actuellement un projet dont l'objectif principal est d'étudier les effets du processus de bioconvection sur l'écophysiologie des principales espèces microbiennes de la chimiocline (BIOCAD 2018-22).

D'autres universités suisses et mondiales sont également attirées par la recherche dans la région de Val Piora, tant en limnologie que dans d'autres domaines comme la botanique et la géologie par exemple.

Écologie microbienne et moléculaire des micro-organismes dans les systèmes d'eau stratifiée

La connaissance des différents organismes du lac de Cadagno est liée aux cycles biogéochimiques des composés les plus importants, notamment le soufre, aux flux d'énergie et aux transformations métaboliques ; cela permet une approche globale du réseau de processus présents dans les systèmes aquatiques complexes. 

Le filon de dolomie (Sacca di Piora ou Pioramulde) de Val Piora, dont on a parlé dans les médias en raison de possibles problèmes liés à la construction du tunnel Alptransit, enrichit une partie des eaux de Val Piora en sels minéraux (carbonates, magnésium, sulfates, etc.). Ces eaux proviennent de sources sous-marines et se stratifient au fond du lac Cadagno. Il en résulte une stratification permanente, ou méromixie, de la masse d'eau avec la formation de deux couches, une couche superficielle (de 0 m à 12 m de profondeur) composée d'eau pauvre en sel et en oxygène, superposée à une couche anoxique (de 12 m à une profondeur maximale de 21 m). Une zone de transition entre oxique et anoxique, communément appelée chimiocline, est présente à environ 12 m ; on y trouve les conditions idéales (lumière, absence d'oxygène, présence de sulfures) pour le développement massif d'une communauté de bactéries sulfureuses anaérobies phototrophes liées au cycle du soufre, qui représentent une production primaire supplémentaire, en plus de celle des algues de la couche superficielle. C'est précisément grâce à l'activité photosynthétique de ces bactéries de la chimiocline que le Cadagno peut accueillir beaucoup plus de poissons qu'un étang alpin ordinaire, ce qui le rend très populaire auprès des pêcheurs. 

Cette zone de transition présente également une stratification verticale relativement stable de populations bactériennes adaptées à différentes profondeurs (par exemple, bactéries phototrophes sulfureuses, chimioorganotrophes, bactéries oxydant le méthane et les sulfures, bactéries réduisant les sulfates et les nitrates, oxydes de fer et de manganèse, méthanogènes, etc.) Ce phénomène naturel, appelé méromixie crénogène, est particulièrement intéressant car il offre la possibilité de suivre les processus de production et de minéralisation de la biomasse à l'état naturel. Le grand avantage offert par le lac de Cadagno est que la stratification des réactions et des populations bactériennes mentionnées est présente sur une épaisseur d'environ 2 mètres, ce qui signifie qu'elles peuvent être facilement échantillonnées. Dans les lacs qui ne présentent pas ce phénomène de stratification de l'eau, ces processus se déroulent généralement entre la masse d'eau et les sédiments sur un espace de quelques centimètres, et donc avec de plus grandes difficultés méthodologiques d'investigation. 

La méromixie crénogène du lac de Cadagno est un phénomène unique dans les Alpes et rare dans le monde entier. Son importance réside dans le fait qu'il représente un habitat naturel de grande biodiversité microbienne qui sert de modèle idéal pour comprendre le rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques globaux. Le concept de biodiversité environnementale au niveau des organismes microscopiques est généralement mal compris, mais il gagne en importance grâce au développement de méthodologies moléculaires spécifiques qui permettent des analyses ciblées, précises et très exactes. 

L'objectif principal des études d'écologie microbienne au LMA-SUPSI est l'analyse et la caractérisation de la composition, de la distribution spatiale et temporelle des espèces clés ainsi que l'étude de la diversité des principales populations microbiennes et de leur activité physiologique dans les différents compartiments du lac.

Projets en cours

Laboratoire d'écologie microbienne Uni-Ge/IM-SUPSI

Bioconvection-mediated microbial ecophysiology in aquatic systems - Multi-scale dynamics in the chemocline of meromictic Lake Cadagno

Le lac de Cadagno présente une stratification permanente de l'eau tout au long de l'année, la couche d'eau supérieure contenant de l'oxygène se trouvant au-dessus d'une couche anoxique très riche en sels dissous. Les bactéries anaérobies à soufre rouge (PSB) de l'espèce Chromatium okenii se développent à l'interface des deux couches, où elles sont capables de mélanger des volumes considérables d'eau, non pas en la remuant directement avec leurs flagelles mais en se regroupant à la recherche de lumière dans une zone restreinte proche du front de diffusion de l'oxygène. Ce faisant, la densité volumique augmente et l'eau commence à tomber, entraînant les micro-organismes avec elle dans un processus connu sous le nom de bioconvection.

L'objectif principal de ce projet (PhD Francesco Di Nezio UNIGE et PostDoc Nicola Storelli SUPSI) est d'étudier les effets du processus de bioconvection sur l'écophysiologie d'espèces microbiennes clés dans les environnements aquatiques. Grâce à une approche multidisciplinaire, les conditions environnementales chimiques et physiques nécessaires au développement optimal des micro-organismes seront d'abord déterminées. Par la suite, les effets éco-physiologiques de la bioconvection seront étudiés en mettant en place des microcosmes en laboratoire et en effectuant des analyses directement dans le lac (grâce aux installations du Centre de Biologie Alpine de Piora). Au terme de ce projet, nous pourrons enfin poser les bases de la compréhension des conséquences de la bioconvection sur l'ensemble de l'écosystème lacustre.

On suppose que les bactéries sulfureuses phototrophes anaérobies étudiées dans ce projet font partie des premières formes de vie apparues sur Terre, lorsque l'oxygène n'était pas encore présent. Ces micro-organismes primitifs pourraient donc représenter le point de départ de tout le processus évolutif qui a conduit à une présence massive et hétérogène de la vie sur notre planète. La comparaison et l'interaction de différentes espèces de sulfobactéries phototrophes très similaires sur le plan écologique, mais très différentes sur le plan physiologique, permettront de révéler des détails importants sur trois lignées évolutives distinctes des trois principales populations bactériennes du lac.

Taux d'assimilation du CO2 et du H2S des plus importantes bactéries sulfureuses phototrophes de la chimiocline du lac Cadagno

Le but de ce projet (master Clarisse Beney UNIGE) est d'analyser les différents taux d'oxydation des sulfures (H2S) et l'efficacité d'assimilation du dioxyde de carbone (CO2) pour les plus importantes populations de bactéries anaérobies phototrophes sulfureuses vivant dans la chimiocline du lac Cadagno, à savoir la bactérie rouge (PSB) Chromatium okenii LaCa, "Thiodictyon syntrophicum" Cad16T et la bactérie verte (GSB) Chlorobium pheobacteroides.

Le taux d'oxydation et l'affinité seront mesurés pour chacun des trois micro-organismes à différentes intensités lumineuses et concentrations de H2S de départ. Pour ces mesures, un micro-respirateur capable de mesurer la plus petite fluctuation de H2S en temps réel (capteur SULF UNISENSE) sera utilisé. En outre, il sera également intéressant d'évaluer d'autres donneurs d'électrons tels que le thiosulfate (S2O32-), ainsi que l'utilisation de S0 stocké intracellulairement pour la PSB ou excrété extérieurement pour la GSB.

La capacité effective et le taux de fixation du CO2 seront évalués pour les trois microorganismes dans différentes conditions en laboratoire, notamment dans des conditions microaérophiles (<5% O2) et dans l'obscurité continue, puis pendant l'été directement dans le lac à l'aide de sacs de dialyse. L'étude sera également complétée par une analyse transcriptomique, principalement pour comparer le métabolisme en présence de lumière avec celui dans l'obscurité. Cette analyse devrait enfin révéler les processus métaboliques qui permettent une bonne activité de fixation du CO2 en l'absence de lumière.

Dynamique de la population

Au cours des 25 dernières années, des techniques d'identification bactérienne de plus en plus efficaces ont été développées et appliquées, puis validées et standardisées de sorte qu'elles sont disponibles en tant que service au LMA-SUPSI (identification et typage des micro-organismes environnementaux). La dynamique des populations bactériennes, en particulier les phototrophes, est fondamentale pour la structure et l'activité écologique du lac. Afin de suivre la dynamique des populations microbiennes du lac de Cadagno, un suivi complet est prévu chaque année (chercheurs du LMA Samuele Roman et Nicola Storelli) au début, au milieu et à la fin de la saison pour les valeurs chimiques à l'aide du kit spectroqunt MERCK, les valeurs physiques à l'aide de la sonde multiparamétrique CTD Sea and Sun et les valeurs biologiques à l'aide de l'hybridation in situ par fluorescence (FISH) et de la cytométrie de flux.

Projets terminés

Génomique fonctionnelle des bactéries sulfureuses pourpres du lac Cadagno

Le projet de doctorat de Samuel Lüdin (2018 UNIGE) était principalement axé sur la génomique et la protéomique des principales bactéries sulfureuses phototrophes anaérobies du lac Cadagno. Au cours de sa thèse, Lüdin a réussi à compléter la séquence chromosomique et plasmidique de 2 espèces très importantes pour l'écologie du lac telles que la souche Cad16T du PSB "Thiodictyon syntrophicum" et la souche LaCa du PSB Chromatium okenii. La connaissance génétique de la communauté des bactéries soufrées phototrophes anaérobies ouvre la porte à de futures analyses méta-protéomiques (ou méta-transcriptomiques) plus détaillées dans le but d'accroître les connaissances sur l'importance écologique de ce type particulier de microorganisme. L'une des principales caractéristiques de cette espèce est sa grande capacité à fixer le CO2 non seulement en présence de lumière, mais aussi dans l'obscurité. Pour cette raison, bien que la souche Cad16T de "T. syntrophicum" ne représente qu'environ 2% de la communauté totale des bactéries sulfureuses anaérobies phototrophes, elle contribue à presque 25% de la production primaire totale du lac Cadagno. D'autres études sur le métabolisme de la souche Cad16T du PSB "T. syntrophicum" ont révélé des facteurs exprimés de manière différentielle dans des conditions de lumière et d'obscurité, qui peuvent maintenant être mieux interprétés grâce à des connaissances génomiques complètes. En outre, cette recherche jette les bases du développement d'expériences ciblées en laboratoire et in situ visant à comprendre le rôle de ces importants microorganismes dans l'écosystème du lac Cadagno. Le projet a été réalisé en collaboration avec le Laboratoire Spiez (Dr. M. Wittwer), la Haute école spécialisée de Zurich-Wädenswil ZHAW (Dr. J. Pothier), la société Mabritec (Dr. V. Pflüger) et l'Université de Genève (Prof. M. Goldschmidt-Clermont et Prof. M. Hothorn).

La cytométrie en flux comme outil d'investigation de la coexistence des bactéries sulfureuses phototrophes anoxygéniques dans la chimiocline du lac méromictique Cadagno.

Le travail de doctorat de Francesco Danza (2018 UNIGE) a porté principalement sur l'utilisation de la cytométrie en flux pour la reconnaissance et le comptage rapide des bactéries sulfureuses phototrophes anaérobies dans le lac Cadagno. En outre, grâce au changement de complexité cellulaire lié à l'accumulation de globules de soufre (S0) pendant la photosynthèse anaérobie, il a été possible d'appliquer la cytométrie en flux pour évaluer également l'activité métabolique de chaque cellule individuelle. Au moyen de la cytométrie en flux, on a tenté de comprendre certains comportements des populations, tant au niveau global qu'individuel. L'idée était de transférer le modèle obtenu avec les données de laboratoire au système plus complexe de l'environnement naturel dans lequel ces micro-organismes vivent en présence d'autres espèces. L'efficacité et la précision de la cytométrie en flux ont également permis d'établir une corrélation entre la turbulence, mesurée par le groupe de recherche du professeur Johny Wuest à l'EPFL, et l'activité motrice de l'espèce Chromatium okenii. Les mesures effectuées directement dans le lac Cadagno appliquées à des simulations mathématiques ont donné lieu à une publication scientifique dans la revue "Geophysics Research Letters", montrant et validant pour la première fois un processus de "bioconvection" dans la nature (auparavant, le phénomène n'avait été observé qu'en laboratoire). Ce travail s'inscrit dans le cadre d'une collaboration entre le groupe "Eaux de surface" de l'EAWAG, le groupe "Microfluidique" de l'ETHZ et le groupe "Biogéochimie" de l'Institut Max Planck de Brême.

(https://archive-ouverte.unige.ch/unige:103201)

Rôle des bactéries sulfureuses phototrophes de la chimiocline dans la production primaire du lac Cadagno

Le travail de doctorat de Nicola Storelli (2014 UNIGE) a montré l'importance des bactéries soufrées phototrophes anaérobies dans la production primaire du lac Cadagno. En effet, ces bactéries contribuent de manière significative à la production primaire totale du lac avec des valeurs élevées de fixation du dioxyde de carbone (CO2) en présence de lumière (photosynthèse) et surtout dans l'obscurité avec un mécanisme encore inconnu. La bactérie sulfureuse rouge PSB Candidatus "Thiodictyon syntrophicum" souche Cad16T s'est avérée être le meilleur assimilateur de CO2 parmi les diverses populations dominées (à l'exclusion de la PSB Chromatium okenii) dans la chimiocline du lac Cadagno et a donc été utilisée comme organisme modèle pour essayer de comprendre la fixation dans l'obscurité. L'analyse des différents protéomes (lumière et obscurité) par électrophorèse sur gel de différence 2D (DIGE) a montré la présence de 23 protéines plus présentes dans la lumière et 17 dans l'obscurité. Parmi les 23 protéines les plus présentes dans la lumière, trois étaient impliquées dans la production de globules de stockage intracellulaires (poly-3-hydroxybutyrate) qui stockent le pouvoir réducteur (NAD(P)H) et les composés carbonés (acétyl-CoA). Dans l'obscurité, parmi les 17 protéines les plus abondantes, trois faisaient partie du cycle autotrophe que l'on ne trouve que dans le royaume des archées, le "dicarboxylate-hydroxybutyrate" (DC/HB). Cependant, ce cycle DC/HB n'est rien d'autre que la somme des cycles plus courants de l'acide tricarboxylique inverse (rTCA) et de la bêta-oxydation, en particulier ce dernier responsable de l'utilisation des globules de stockage produits en présence de lumière (poly-3-hydroxybutyrate). 

En outre, les séquences brutes du génome (contigs) séquencées pour la première fois à partir de la souche Cad16T ont révélé la présence de deux gènes RuBisCO (cbbLS et cbbM), cruciaux pour la fixation du CO2 par le cycle de Calvin, qui sont exprimés de manière différentielle. La CbbM de type II de RuBisCO est exprimée de manière constitutive (non régulée) tandis que la CbbLS de type I de RuBisCO, plus évoluée, est soumise à une régulation par son environnement.

(https://archive-ouverte.unige.ch/unige:34915)

Institut cantonal de microbiologie (ICM)

Agrégats syntrophiques de Thiodictyon syntrophicum CAD16 et Desulfocapsa thiozymogenes CAD626 du lac Cadagno

Le lac Cadagno et les lacs à stratification permanente en général sont des modèles idéaux pour l'étude des microorganismes aquatiques. Le lac Cadagno est particulièrement intéressant pour la présence de populations de bactéries sulfureuses photo-synthétiques et de bactéries sulfato-réductrices. Ces dernières années, il a été démontré que les bactéries photosynthétiques à soufre rouge appartenant à l'espèce candidate Thiodictyon syntropicum Cad16 et les bactéries sulfato-réductrices de l'espèce Desulfocapsa thiozymogenes Cad626 sont capables de s'associer en structures appelées agrégats. Jusqu'à présent, une étude détaillée de la manière dont l'agrégation pouvait avoir lieu n'était pas réalisable en raison de l'impossibilité de reproduire la structure des agrégats en laboratoire. Avec cette thèse de master dirigée par Nicholas Vecchietti (2011 UNI Insubria), pour la première fois, nous avons réussi à identifier les conditions idéales qui permettent la reproduction de l'agrégat bactérien en laboratoire.

Paléo-microbiologie des sédiments du lac Cadagno

Une recherche interdisciplinaire sur les sédiments anoxiques du lac Cadagno a été menée en 2009 en collaboration avec l'ETH Zurich, l'Université de Bâle et NordCEE Danemark. Cette recherche permet d'étudier les glissements de terrain et est combinée à l'histoire de l'évolution des populations microbiennes qui se sont produites dans le lac. 

En particulier, un projet de recherche post-doctoral (Damiana Ravasi) a porté sur l'extraction d'ADN subfossile à partir d'échantillons provenant de différentes profondeurs du sédiment anoxique. La quantification des séquences d'ARN ribosomal subfossiles de différentes populations de bactéries phototrophes sulfureuses a permis de mettre en évidence leur présence dans tout le sédiment. Les populations bactériennes présentent des variations de concentration en fonction de la profondeur à laquelle elles ont été trouvées, indiquant l'existence de changements importants dans l'histoire biologique du lac. La datation de la carotte de sédiments de 10 mètres, qui correspond à l'histoire biologique de 10 000 ans, est en cours.

Approche moléculaire à l'étude des bactéries sulfato-réductrices et des Archaea méthanogènes dans les sédiments des lacs Cadagno et Rotsee.

Le travail de thèse de Michel Bottinelli (UNIGE 2008) avait pour but de comparer les étapes finales de la minéralisation microbienne, à travers l'examen de la méthanogenèse et de la réduction des sulfates, dans les sédiments profonds de deux lacs présentant des concentrations en sulfates différentes (lac Cadagno et lac Rotsee). Dans le lac Cadagno, la réduction des sulfates domine ([SO₄²-] = ~ 3 mM ; [S²-] = 2-3 mM), tandis que le lac Rotsee montre une prédominance de la méthanogénèse ([CH₄] = 5 mM ; [SO₄²-] = ~ 1 μM). À l'interface eau-sédiment, les valeurs de COT et de THAA étaient deux fois plus élevées à Cadagno (149 et 77 mg g-¹ de sédiment). L'analyse de l'ADNr 16S a montré une prévalence des bactéries avec une moyenne de 59% et 15%, y compris 55% et 10% de bactéries sulfato-réductrices (SRB) ainsi que le royaume "Archaea" avec 27% et 4% dans les profils DGGE du lac Cadagno et Rotsee respectivement. En outre, les sédiments du lac Cadagno ont montré une plus grande diversité d'ADNr 16S bactérien à différents niveaux de sédiments. 

(https://archive-ouverte.unige.ch/unige:98209)

Prolifération de nouvelles bactéries sulfureuses phototrophes dans la chimiocline du lac méromictique Cadagno : quelles conséquences?

Suite à un événement extraordinaire de mélange d'eau en octobre 2000, un changement dans les populations de sulfobactéries phototrophes vertes (GSB) a été observé, de Chlorobium phaeobacteriodes à Chlorobium clathratiforme. Une augmentation de l'abondance des GSB par rapport aux sulfobactéries phototrophes totales a également été observée : de 5-10% entre 1994 et 1999 à 95% en 2002.  

L'étude "diplôme d'études approfondies (DEA)" menée par Paola Decristophoris (2007 UNIGE) avait pour objectif de mettre en évidence la répartition dans la chimiocline des sulfobactéries phototrophes vertes (GSB) et des sulfobactéries violettes (PSB), deux familles aux besoins métaboliques très similaires, et de comprendre si les changements d'abondance relative entre les deux groupes taxonomiques avaient un effet sur la distribution verticale des populations de PSB.

La biomasse totale des sulfobactéries phototrophes a été multipliée par trois entre 1998 et 2004. Cette augmentation était directement liée à la prolifération des GSBs, la biomasse des PSBs restant inchangée. Il semblerait également que cela n'ait pas eu d'impact sur la microstratification des PSBs à différentes profondeurs dans la colonne d'eau. La prolifération des GSBs suggère l'apparition, dans la chimiocline du lac de Cadagno, après 1999, d'une niche écologique que C. clathratiforme a pu coloniser sans aucun impact mesurable sur les autres sulfobactéries phototrophes déjà présentes.

Interactions entre les bactéries sulfato-réductrices et les bactéries du soufre pourpre dans la chimiocline du lac méromictique Cadagno

Notre attention, tout en maintenant les aspects phylogénétiques, s'était déplacée davantage vers l'analyse des activités physiologiques, des interactions avec le milieu extérieur (eau du lac) et entre organismes (syntropie et symbiose). En effet, le travail de doctorat de Sandro Peduzzi (2003 ETHZ), en collaboration avec l'Université Rutgers de Newark, USA (D. Hahn) et l'EAWAG (ETH) de Dúbendorf (A. Zehnder), portait sur la formation d'un agrégat bactérien dans le lac Cadagno. Dans la chimiocline (11-14 m) du lac Cadagno, une partie de la communauté microbienne se développe pour former une structure appelée agrégat ; celle-ci est composée de deux espèces bactériennes : les bactéries sulfureuses rouges (PSB) de la famille des Chromatiaceae (Thiodictyon sp.) et les bactéries sulfato-réductrices (SRB) de la famille des Desulfovibrionaceae (Desulfocapsa thiozymogenes). L'association d'agrégation étroite est spécifique à l'espèce mais non obligatoire et est bénéfique pour la survie des deux espèces impliquées. Le projet s'est concentré sur l'identification des conditions chimiques et physiques qui induisent la formation de l'agrégat et la compréhension de sa structure (études tridimensionnelles par microscopie confocale) afin de clarifier son rôle éco-physiologique.

Isolement de bactéries anaérobies du lac Cadagno (fin des années 1990) 

Avec les techniques d'isolement et de culture anaérobie pour les bactéries phototrophes (par exemple Lamprocystis) et sulfato-réductrices (par exemple Desulfocapsa), la voie a été ouverte aux études physiologiques en laboratoire combinées aux méthodes moléculaires. La culture et l'étude des activités métaboliques de ces micro-organismes sont en corrélation avec les activités de leur habitat et ouvrent la voie à des développements biotechnologiques intéressants, comme la culture de bactéries phototrophes capables de purifier l'eau de substances nocives telles que les sulfures et l'ammoniac ou la culture de bactéries capables de dégrader des polluants difficiles à éliminer de l'environnement, comme les pesticides, et en particulier les organohalogénés (genre Desulfomonile).

Caractérisation des bactéries anaérobies dans le lac Cadagno

L'introduction de méthodes d'analyse directe ou "in situ" avec le microscope à fluorescence a été décidée après les premiers travaux des années 1980, basés sur les méthodes classiques de la microbiologie environnementale, étant donné le faible pourcentage de bactéries cultivables (<0,1 %) dans les échantillons prélevés dans le lac par rapport aux bactéries réellement présentes. Grâce à la collaboration avec le CNR-Istituto di Ricerca per gli Ecosistemi de Pallanza, les comptages de bactéries cultivables ont été complétés par des comptages directs de bactéries totales après coloration des acides nucléiques. Grâce à ces méthodes, il a été possible de découvrir et d'énumérer séparément des morphotypes bactériens particuliers et abondants dans les différentes couches du lac (travail de diplôme J.-C Bensadoun 1995). L'acquisition de la technique "Whole Cell Hybridization (WCH)" en collaboration avec l'Institut d'écologie terrestre de l'ETH Zurich (D. Hahn) et l'Université technique de Munich et l'Institut Max Planck de Brême (R. Amann) a initié l'introduction de méthodes de détection moléculaire "in situ" appliquées aux échantillons du lac de Cadagno. Les premiers comptages après hybridation cellulaire ont été effectués au cours de l'année 1994. 

En 1995, l'introduction de l'amplification automatisée des acides nucléiques (PCR) et de leur séquençage a permis d'entamer les premiers travaux d'amplification et de clonage des gènes codant pour les ARN ribosomiques 16S, ouvrant ainsi de larges possibilités de typage des souches non cultivables et d'analyse des populations microbiennes environnementales. Ce travail a permis de développer des techniques de détection spécifiques des bactéries présentes dans le lac Cadagno afin de décrire leur distribution spatio-temporelle. Cela a permis de découvrir des espèces de bactéries phototrophes et sulfuro-réductrices qui n'avaient jamais été décrites auparavant et qui sont présentes dans la zone de transition entre les couches oxique et anoxique du lac.

Début des activités de recherche

Considérant que les activités de formation doivent toujours être soutenues par une recherche continue et actualisée, l'ICM a décidé depuis 1992 de reprendre et d'encourager, même en dehors des cours de formation, les recherches visant à comprendre la microbiologie du lac de Cadagno. Outre les méthodes classiques, qui sont importantes pour la comparaison avec les données antérieures et avec d'autres écosystèmes, de nouvelles techniques ont été développées sur des bases moléculaires et biophysiques, en particulier les techniques moléculaires de détection in situ, qui permettent d'obtenir une plus grande spécificité et une haute résolution dans l'espace et dans le temps.